MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 11668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010577	C	6	6	1359	1364	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_010577	ACT	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010577	AAAT	2	8	1399	1406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010577	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010577	ACA	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010577	A	8	8	1568	1575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010577	ACC	4	12	1581	1592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_010577	ATA	2	6	2755	2760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010577	ATA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010577	T	7	7	2786	2792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010577	ATTTA	2	10	2811	2820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010577	TAA	2	6	2828	2833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010577	TAA	2	6	2883	2888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010577	TTTA	2	8	2889	2896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010577	TGT	2	6	2919	2924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010577	T	6	6	2927	2932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010577	ATG	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010577	TTA	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010577	T	6	6	2971	2976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010577	TCA	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010577	TTC	2	6	2989	2994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010577	ATT	2	6	4174	4179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010577	TCT	2	6	4220	4225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010577	ATT	2	6	4317	4322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010577	AT	3	6	4363	4368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010577	T	6	6	4373	4378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010577	AGAA	2	8	4408	4415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010577	TTA	2	6	7081	7086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010577	TGT	2	6	7098	7103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010577	GAA	2	6	7979	7984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010577	TCT	2	6	8845	8850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010577	AT	3	6	8894	8899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010577	TTTC	2	8	8903	8910	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010577	TTTA	2	8	10255	10262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010577	TAC	2	6	10295	10300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010577	T	6	6	10384	10389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010577	CAAT	2	8	10391	10398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010577	TGG	2	6	10458	10463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010577	GCG	2	6	10469	10474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010577	AAT	2	6	11242	11247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010577	ATC	2	6	11306	11311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010577	AAC	2	6	11312	11317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010577	ATC	2	6	12125	12130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010577	AATC	2	8	12987	12994	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_010577	TAC	2	6	13002	13007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010577	TG	3	6	13059	13064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010577	T	8	8	13068	13075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010577	ATAC	2	8	13129	13136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010577	GC	3	6	13154	13159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010577	AGC	2	6	13259	13264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010577	AAAG	2	8	13301	13308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010577	TGT	2	6	13469	13474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010577	TGA	2	6	13476	13481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010577	AT	3	6	13499	13504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010577	GCT	2	6	13594	13599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010577	CTT	2	6	13690	13695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010577	TTG	2	6	16127	16132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010577	GCC	2	6	16754	16759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010577	GCA	2	6	16803	16808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010577	TCC	2	6	17879	17884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010577	CTG	2	6	17886	17891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010577	TCA	2	6	17912	17917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010577	AAG	2	6	18004	18009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010577	GCAG	2	8	18027	18034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010577	TGA	2	6	18086	18091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010577	CTG	2	6	18122	18127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010577	TCCT	2	8	18137	18144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010577	CTGC	2	8	18299	18306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010577	TCA	2	6	18353	18358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010577	TGA	2	6	18380	18385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010577	TTATG	2	10	18410	18419	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010577	GTT	2	6	18464	18469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010577	GT	3	6	18586	18591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010577	CAAT	2	8	18676	18683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010577	TGT	3	9	18729	18737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010577	TG	3	6	18748	18753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010577	GTA	2	6	18792	18797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010577	CTC	2	6	18801	18806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_010577	TTG	2	6	18877	18882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010577	GCT	2	6	18884	18889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010577	CTG	2	6	18892	18897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010577	ATT	2	6	18903	18908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010577	GCA	2	6	18948	18953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010577	GCA	2	6	18987	18992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010577	ATG	2	6	18997	19002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010577	GAC	2	6	19033	19038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010577	CG	5	10	19043	19052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010577	CGC	2	6	19061	19066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010577	GGT	2	6	19147	19152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010577	GT	3	6	19184	19189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010577	CCG	2	6	19206	19211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010577	CAT	2	6	19251	19256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010577	GTCGT	2	10	19257	19266	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_010577	GTG	2	6	19286	19291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010577	CTG	2	6	19298	19303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010577	ATG	2	6	19340	19345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010577	TG	4	8	19344	19351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010577	TC	3	6	19358	19363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010577	TTG	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010577	GGCAAC	25	150	19388	19537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010577	GTGG	2	8	19603	19610	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010577	TGTGC	13	65	19667	19731	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_010577	CGT	2	6	19764	19769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010577	AG	3	6	19779	19784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010577	TTG	2	6	19814	19819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010577	TCAG	2	8	19895	19902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_010577	TGC	2	6	19924	19929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010577	GGT	2	6	19955	19960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010577	GAT	2	6	19966	19971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010577	CTG	2	6	19994	19999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010577	CG	3	6	20056	20061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_010577	A	6	6	20117	20122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010577	AAG	2	6	20154	20159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010577	GT	4	8	20265	20272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010577	CGT	2	6	20337	20342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010577	CTT	2	6	20443	20448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010577	GTCA	2	8	20486	20493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010577	TGA	3	9	20553	20561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010577	TAG	2	6	20575	20580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010577	TTG	2	6	20594	20599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010577	ATC	2	6	20609	20614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010577	TGG	2	6	20625	20630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010577	CAG	2	6	20634	20639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010577	CAAC	2	8	20652	20659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010577	GCT	2	6	20673	20678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010577	T	6	6	20706	20711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010577	G	6	6	20713	20718	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010577	T	7	7	20969	20975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010577	ATT	2	6	20976	20981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010577	ATT	2	6	21019	21024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010577	TGC	2	6	21046	21051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010577	A	6	6	21073	21078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010577	TCC	2	6	21185	21190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010577	T	6	6	21250	21255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010577	CCA	2	6	21303	21308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_010577	GGC	2	6	21316	21321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010577	CAT	2	6	21326	21331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010577	AC	3	6	21386	21391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_010577	AGTT	2	8	21456	21463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010577	A	6	6	21476	21481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010577	GGA	2	6	22632	22637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010577	A	6	6	22644	22649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010577	GCC	2	6	22650	22655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_010577	GGC	2	6	22665	22670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010577	AG	3	6	22699	22704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010577	GAA	2	6	22734	22739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_010577	CGC	2	6	46370	46375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_010577	GAAT	2	8	46403	46410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010577	CAGTG	2	10	46499	46508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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465	NC_010577	AGG	2	6	63534	63539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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